Евгений Попов родился в 1978 году во Владивостоке.
Журналистикой Евгений увлекся еще в детстве, с 13 лет работал ведущим программы «Саквояж». После окончания школы поступил на факультет журналистики Дальневосточного государственного университета и продолжал работать на местном телевидении корреспондентом программы новостей.
В 2000 году после окончания университета Евгения Попова пригласили в «Вести» на должность корреспондента во Владивостоке и Приморском крае. «Наступило глобальное профессиональное счастье», — вспоминал позже журналист.
Через два года он переезжает на работу в Москву, а спустя несколько месяцев уже работает в украинском корпункте телеканала «Россия».
В 2006 году Евгений вернулся в Москву и продолжил работу политическим обозревателем программы «Вести недели» на ВГТРК.
С 2008 по 2013 год журналист возглавлял нью-йоркское бюро «Вестей».
После возвращения на родину в 2013 году Евгений Попов стал политическим обозревателем «Вестей». Одновременно в качестве репортера освещал события на Украине для программы «Специальный корреспондент».
Евгений Попов — автор многих резонансных документальных фильмов, среди которых «Телемайдан», «Блокада. Славянск», «Киевская сечь», «Медиаграмотность». За объективное освещение украинских событий и войны на Донбассе, а также за поддержку присоединения Крыма к России Евгению Попову запрещен въезд на Украину.
С сентября 2016-го — ведущий политического ток-шоу «60 минут» совместно со своей супругой Ольгой Скабеевой. За короткое время программа вошла в тройку лучших общественно-политических передач российского телевидения.
Награжден «Золотым пером России» от Союза журналистов за развитие дискуссионной политики на телевидении», премиями ТЭФИ-2017, «ТЭФИ-2018».
В 2021 году избран депутатом Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации VIII созыва по избирательному округу № 197 (Кунцевский — город Москва). Является заместителем сопредседателя Межпарламентской группы Российской Федерации и заместителем председателя комитета по информационной политике, информационным технологиям и связи.